Estudia los microorganismos en su ambiente natural, los cuales mantienen una actividad continua imprescindible para la vida en lo Tierra. Los mecanismos que mantienen la diversidad microbiana de la biosfera son la base de la dinámica de los ecosistemas terrestres, acuáticos y aéreos. Es decir, la base de la existencia de las selvas y de los sistemas agrícolas, entre otros. La diversidad microbiana del suelo es la causa de la fertilidad del mismo. Comúnmente no se concibe la extinción de las comunidades microbianas; sin embargo, el impacto de esta posibilidad será evidente cuando decaigan las funciones ecosistémicas reguladas por los microorganismos.
Ecología de Poblaciones
También llamada demoecología o ecología demográfica, estudia las poblaciones formadas por los organismos de una misma especie desde el punto de vista de sus tamaño (número de individuos), estructura (sexo y edad) y dinámica (variación en el tiempo). Una población desde el punto de vista ecológico se define como el conjunto de individuos de la misma especie que ocupan un lugar y tiempo determinado, que además tienen descendencia fértil.
Ecología de Comunidades
Se encarga del estudio del nivel de organización superior de la materia viva llamada comunidad. La comunidad es un conjunto de poblaciones de diferentes especies que comparten un lugar común en el espacio llamado hábitat, La diversidad calculada con un índice matemático tiene dos componentes: la riqueza, que es el número de especies y la equitatividad, que es el grado en el que las diferentes especies son similares en cuanto a su abundancia,
Biogeografía
Estudia la distribución de los seres vivos sobre la Tierra, así como los procesos que la han originado, que la modifican y que la pueden hacer desaparecer. Es una ciencia interdisciplinaria.
Etoecología
Estudia el comportamiento de los seres vivos en el ambiente, La etocecología estudia las costumbres, las conductas, los hábitos, las normas, las actuaciones, las prácticas, los estilos y pautas en el ambiente de un ser orgánico animal o vegetal o de una sociedad.
Autoecología
Sinecología
Estudia las relaciones entre diversas especies pertenecientes a un mismo grupo y el medio en que vive.
Ecología Aplicada
Estudia la tendencia moderna de protección a la naturaleza y el equilibrio de ésta en el medio ambiente rural y urbano.
Ecología de Sistemas
Emplea las matemáticas aplicadas en modelos matemáticos y de computadora para la comprensión de la problemática ecológica.
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